校医院为学校自设教辅单位，由主管校长直管，收支由学校财务处管理，包括秦皇岛校区校医院、开发区校区校医院、昌黎校区校医院。三个校区校医院共有职工37人，包括正式职工12人，聘用职工25人；其中专职卫生专业技术人员23人，包括医生14人，护士7人，药剂2人。

校医院现有血球仪、全自动生化仪、离心机、B超机、尿常规检查仪、胸透X光机、心电图机等仪器设备，三个校区通过广电独立局域网实现医院计算机管理系统和医保统筹实时联网。

校医院设有预防保健科、全科医疗科、内科、外科、医学检验科、医学影像科、中医科、中西医结合科等科室，承担日常门诊医疗、职工及学生医疗保险、学校传染病防控、健康教育、新生及毕业生体检、离休人员医药费审核、省直保健对象体检衔接、学校活动医疗保健服务、核酸检测及疫情防控等多项工作。