校医院为学校教辅（直属）单位，包括秦皇岛校区校医院、开发区校区校医院、昌黎校区校医院。三个校区校医院共有职工35人，包括正式职工9人，聘用职工26人；其中专职卫生专业技术人员23人，包括医生14人，护士8人，药剂1人。

校医院现有血球仪、全自动生化仪、离心机、B超机、尿常规检查仪、胸透X光机、心电图机等仪器设备，三个校区通过广电独立局域网实现医院计算机管理系统和医保统筹实时联网。

校医院设有预防保健科、内科、外科（普通外科）、医学检验科、中医科、医学影像科等科室，承担日常门诊医疗、职工及学生医疗保险、学校传染病防控、健康教育、新生及毕业生体检、离休人员医药费审核、省直保健对象体检衔接、学校活动医疗保健服务等多项工作。